Protein–RNA interactions for Protein: O00339

MATN2, Matrilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN2O00339 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MATN2O00339 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN2O00339 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN2O00339 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN2O00339 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN2O00339 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN2O00339 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MATN2O00339 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN2O00339 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MATN2O00339 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MATN2O00339 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MATN2O00339 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN2O00339 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN2O00339 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN2O00339 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN2O00339 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MATN2O00339 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MATN2O00339 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MATN2O00339 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MATN2O00339 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN2O00339 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN2O00339 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN2O00339 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MATN2O00339 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN2O00339 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN2O00339 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN2O00339 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MATN2O00339 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN2O00339 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN2O00339 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN2O00339 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN2O00339 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN2O00339 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MATN2O00339 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN2O00339 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN2O00339 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN2O00339 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN2O00339 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN2O00339 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN2O00339 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MATN2O00339 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms