Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP2O00295 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP2O00295 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TULP2O00295 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP2O00295 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP2O00295 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP2O00295 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP2O00295 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP2O00295 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TULP2O00295 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP2O00295 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP2O00295 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP2O00295 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP2O00295 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP2O00295 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP2O00295 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TULP2O00295 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP2O00295 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP2O00295 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TULP2O00295 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TULP2O00295 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP2O00295 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP2O00295 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP2O00295 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP2O00295 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP2O00295 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TULP2O00295 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP2O00295 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP2O00295 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TULP2O00295 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP2O00295 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP2O00295 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP2O00295 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP2O00295 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TULP2O00295 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TULP2O00295 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP2O00295 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP2O00295 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP2O00295 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP2O00295 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TULP2O00295 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TULP2O00295 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP2O00295 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP2O00295 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TULP2O00295 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TULP2O00295 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TULP2O00295 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms