Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYO1FO00160 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYO1FO00160 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYO1FO00160 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms