Protein–RNA interactions for Protein: O00142

TK2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK2O00142 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TK2O00142 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TK2O00142 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TK2O00142 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TK2O00142 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TK2O00142 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TK2O00142 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TK2O00142 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TK2O00142 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TK2O00142 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TK2O00142 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TK2O00142 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TK2O00142 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TK2O00142 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TK2O00142 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TK2O00142 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TK2O00142 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TK2O00142 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TK2O00142 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TK2O00142 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TK2O00142 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TK2O00142 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TK2O00142 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TK2O00142 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TK2O00142 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TK2O00142 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TK2O00142 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK2O00142 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK2O00142 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK2O00142 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK2O00142 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK2O00142 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK2O00142 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TK2O00142 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TK2O00142 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TK2O00142 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TK2O00142 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TK2O00142 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TK2O00142 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TK2O00142 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TK2O00142 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TK2O00142 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TK2O00142 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TK2O00142 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TK2O00142 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TK2O00142 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TK2O00142 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms