Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN8O00124 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
UBXN8O00124 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBXN8O00124 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms