Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOC4-APOC2K7ER74 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms