Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3QW42 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3QW42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QW42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QW42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QW42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
J3QW42 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QW42 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QW42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QW42 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QW42 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QW42 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
J3QW42 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
J3QW42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
J3QW42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
J3QW42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QW42 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QW42 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QW42 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QW42 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QW42 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QW42 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
J3QW42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
J3QW42 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
J3QW42 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QW42 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QW42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QW42 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QW42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QW42 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
J3QW42 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QW42 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
J3QW42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms