Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1D1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1D1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
H7C1D1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1D1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1D1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1D1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1D1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1D1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1D1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H7C1D1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1D1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1D1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1D1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1D1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1D1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1D1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
H7C1D1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
H7C1D1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1D1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1D1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1D1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1D1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
H7C1D1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
H7C1D1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
H7C1D1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1D1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1D1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
H7C1D1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
H7C1D1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
H7C1D1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
H7C1D1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
H7C1D1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
H7C1D1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
H7C1D1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1D1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1D1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
H7C1D1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1D1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1D1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1D1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1D1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
H7C1D1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1D1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1D1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1D1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1D1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1D1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
H7C1D1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
H7C1D1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1D1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1D1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1D1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
H7C1D1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1D1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1D1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1D1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1D1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
H7C1D1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1D1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1D1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1D1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1D1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
H7C1D1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1D1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1D1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1D1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1D1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
H7C1D1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1D1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1D1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1D1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1D1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1D1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
H7C1D1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms