Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H7C1C5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H7C1C5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H7C1C5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
H7C1C5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
H7C1C5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H7C1C5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H7C1C5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H7C1C5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
H7C1C5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
H7C1C5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H7C1C5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H7C1C5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H7C1C5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H7C1C5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H7C1C5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H7C1C5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H7C1C5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H7C1C5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H7C1C5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H7C1C5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H7C1C5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H7C1C5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H7C1C5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
H7C1C5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
H7C1C5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
H7C1C5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H7C1C5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H7C1C5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
H7C1C5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
H7C1C5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H7C1C5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
H7C1C5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
H7C1C5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
H7C1C5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
H7C1C5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
H7C1C5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms