Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C0C1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C0C1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C0C1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C0C1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C0C1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C0C1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C0C1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C0C1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C0C1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H7C0C1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C0C1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C0C1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C0C1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C0C1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C0C1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C0C1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C0C1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C0C1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C0C1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C0C1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C0C1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C0C1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H7C0C1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H7C0C1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H7C0C1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H7C0C1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H7C0C1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H7C0C1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H7C0C1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H7C0C1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
H7C0C1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H7C0C1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H7C0C1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H7C0C1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H7C0C1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms