Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLGA8SH3BPF8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GOLGA8SH3BPF8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GOLGA8SH3BPF8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms