Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms