Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRRT4C9JH25 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PRRT4C9JH25 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRRT4C9JH25 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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