Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9J4A7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9J4A7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9J4A7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9J4A7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9J4A7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9J4A7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C9J4A7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9J4A7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C9J4A7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C9J4A7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9J4A7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9J4A7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9J4A7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9J4A7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9J4A7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C9J4A7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C9J4A7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9J4A7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9J4A7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9J4A7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9J4A7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9J4A7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9J4A7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9J4A7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9J4A7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9J4A7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9J4A7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9J4A7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9J4A7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9J4A7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9J4A7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9J4A7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9J4A7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms