Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf172C9J069 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf172C9J069 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9orf172C9J069 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf172C9J069 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms