Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HNRNPCL3B7ZW38 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HNRNPCL3B7ZW38 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms