Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
B4E171 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4E171 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4E171 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4E171 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4E171 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B4E171 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B4E171 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4E171 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B4E171 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B4E171 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4E171 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4E171 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4E171 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4E171 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4E171 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
B4E171 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
B4E171 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4E171 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4E171 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4E171 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4E171 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4E171 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B4E171 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4E171 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
B4E171 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4E171 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4E171 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4E171 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4E171 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4E171 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4E171 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4E171 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
B4E171 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4E171 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4E171 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
B4E171 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4E171 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4E171 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4E171 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4E171 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4E171 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
B4E171 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4E171 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4E171 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4E171 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms