Protein–RNA interactions for Protein: B4DS77

SHISA9, Protein shisa-9, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA9B4DS77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA9B4DS77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHISA9B4DS77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHISA9B4DS77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHISA9B4DS77 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms