Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMEM114B3SHH9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM114B3SHH9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms