Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4EB2RXH2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KDM4EB2RXH2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms