Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCT8L1PA6NM43 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCT8L1PA6NM43 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCT8L1PA6NM43 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms