Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SAC3D1A6NKF1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SAC3D1A6NKF1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SAC3D1A6NKF1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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