Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLTPD2A6NH11 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLTPD2A6NH11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
GLTPD2A6NH11 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GLTPD2A6NH11 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms