Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRIT2A6NDA9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRIT2A6NDA9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRIT2A6NDA9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms