Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L3A6NCW0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L3A6NCW0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L3A6NCW0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L3A6NCW0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms