Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNOT1A5YKK6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNOT1A5YKK6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNOT1A5YKK6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT1A5YKK6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms