Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTAGE9A4FU28 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTAGE9A4FU28 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms