Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PRAMEF22A3QJZ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms