Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HMX2A2RU54 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMX2A2RU54 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMX2A2RU54 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms