Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPAARA0A1B0GVQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAARA0A1B0GVQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAARA0A1B0GVQ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms