Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
A0A0U1RRA0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
A0A0U1RRA0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
A0A0U1RRA0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms