Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GJA3Q9Y6H8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GJA3Q9Y6H8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
GJA3Q9Y6H8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
GJA3Q9Y6H8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
GJA3Q9Y6H8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
GJA3Q9Y6H8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
GJA3Q9Y6H8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
GJA3Q9Y6H8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
GJA3Q9Y6H8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
GJA3Q9Y6H8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
GJA3Q9Y6H8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
GJA3Q9Y6H8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
GJA3Q9Y6H8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
GJA3Q9Y6H8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
GJA3Q9Y6H8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
GJA3Q9Y6H8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
GJA3Q9Y6H8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
GJA3Q9Y6H8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GJA3Q9Y6H8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
GJA3Q9Y6H8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GJA3Q9Y6H8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GJA3Q9Y6H8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GJA3Q9Y6H8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GJA3Q9Y6H8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GJA3Q9Y6H8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GJA3Q9Y6H8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GJA3Q9Y6H8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
GJA3Q9Y6H8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GJA3Q9Y6H8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GJA3Q9Y6H8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GJA3Q9Y6H8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GJA3Q9Y6H8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GJA3Q9Y6H8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GJA3Q9Y6H8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
GJA3Q9Y6H8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GJA3Q9Y6H8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GJA3Q9Y6H8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GJA3Q9Y6H8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GJA3Q9Y6H8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GJA3Q9Y6H8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GJA3Q9Y6H8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GJA3Q9Y6H8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GJA3Q9Y6H8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GJA3Q9Y6H8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
GJA3Q9Y6H8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GJA3Q9Y6H8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GJA3Q9Y6H8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GJA3Q9Y6H8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GJA3Q9Y6H8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GJA3Q9Y6H8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
GJA3Q9Y6H8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GJA3Q9Y6H8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GJA3Q9Y6H8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GJA3Q9Y6H8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
GJA3Q9Y6H8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
GJA3Q9Y6H8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GJA3Q9Y6H8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GJA3Q9Y6H8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GJA3Q9Y6H8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
GJA3Q9Y6H8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GJA3Q9Y6H8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
GJA3Q9Y6H8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJA3Q9Y6H8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
GJA3Q9Y6H8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJA3Q9Y6H8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GJA3Q9Y6H8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GJA3Q9Y6H8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJA3Q9Y6H8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
GJA3Q9Y6H8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
GJA3Q9Y6H8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GJA3Q9Y6H8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJA3Q9Y6H8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJA3Q9Y6H8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GJA3Q9Y6H8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GJA3Q9Y6H8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
GJA3Q9Y6H8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GJA3Q9Y6H8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
GJA3Q9Y6H8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
GJA3Q9Y6H8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
GJA3Q9Y6H8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GJA3Q9Y6H8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
GJA3Q9Y6H8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
GJA3Q9Y6H8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GJA3Q9Y6H8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GJA3Q9Y6H8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
GJA3Q9Y6H8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GJA3Q9Y6H8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GJA3Q9Y6H8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GJA3Q9Y6H8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
GJA3Q9Y6H8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
GJA3Q9Y6H8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.7 ms