Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CYP46A1Q9Y6A2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CYP46A1Q9Y6A2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CYP46A1Q9Y6A2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CYP46A1Q9Y6A2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CYP46A1Q9Y6A2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CYP46A1Q9Y6A2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CYP46A1Q9Y6A2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CYP46A1Q9Y6A2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CYP46A1Q9Y6A2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CYP46A1Q9Y6A2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CYP46A1Q9Y6A2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CYP46A1Q9Y6A2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CYP46A1Q9Y6A2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CYP46A1Q9Y6A2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CYP46A1Q9Y6A2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CYP46A1Q9Y6A2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CYP46A1Q9Y6A2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CYP46A1Q9Y6A2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CYP46A1Q9Y6A2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP46A1Q9Y6A2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP46A1Q9Y6A2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYP46A1Q9Y6A2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CYP46A1Q9Y6A2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CYP46A1Q9Y6A2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CYP46A1Q9Y6A2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CYP46A1Q9Y6A2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CYP46A1Q9Y6A2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CYP46A1Q9Y6A2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CYP46A1Q9Y6A2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CYP46A1Q9Y6A2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYP46A1Q9Y6A2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CYP46A1Q9Y6A2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CYP46A1Q9Y6A2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP46A1Q9Y6A2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP46A1Q9Y6A2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP46A1Q9Y6A2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CYP46A1Q9Y6A2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CYP46A1Q9Y6A2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CYP46A1Q9Y6A2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CYP46A1Q9Y6A2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CYP46A1Q9Y6A2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CYP46A1Q9Y6A2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CYP46A1Q9Y6A2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CYP46A1Q9Y6A2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CYP46A1Q9Y6A2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CYP46A1Q9Y6A2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CYP46A1Q9Y6A2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CYP46A1Q9Y6A2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CYP46A1Q9Y6A2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CYP46A1Q9Y6A2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CYP46A1Q9Y6A2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CYP46A1Q9Y6A2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CYP46A1Q9Y6A2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CYP46A1Q9Y6A2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CYP46A1Q9Y6A2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CYP46A1Q9Y6A2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CYP46A1Q9Y6A2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CYP46A1Q9Y6A2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CYP46A1Q9Y6A2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CYP46A1Q9Y6A2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CYP46A1Q9Y6A2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CYP46A1Q9Y6A2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CYP46A1Q9Y6A2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CYP46A1Q9Y6A2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CYP46A1Q9Y6A2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CYP46A1Q9Y6A2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CYP46A1Q9Y6A2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CYP46A1Q9Y6A2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CYP46A1Q9Y6A2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CYP46A1Q9Y6A2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms