Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ANGPTL3Q9Y5C1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ANGPTL3Q9Y5C1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ANGPTL3Q9Y5C1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ANGPTL3Q9Y5C1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ANGPTL3Q9Y5C1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ANGPTL3Q9Y5C1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ANGPTL3Q9Y5C1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ANGPTL3Q9Y5C1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ANGPTL3Q9Y5C1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ANGPTL3Q9Y5C1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ANGPTL3Q9Y5C1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ANGPTL3Q9Y5C1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ANGPTL3Q9Y5C1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ANGPTL3Q9Y5C1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ANGPTL3Q9Y5C1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ANGPTL3Q9Y5C1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ANGPTL3Q9Y5C1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ANGPTL3Q9Y5C1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ANGPTL3Q9Y5C1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ANGPTL3Q9Y5C1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ANGPTL3Q9Y5C1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ANGPTL3Q9Y5C1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ANGPTL3Q9Y5C1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANGPTL3Q9Y5C1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ANGPTL3Q9Y5C1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ANGPTL3Q9Y5C1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANGPTL3Q9Y5C1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ANGPTL3Q9Y5C1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANGPTL3Q9Y5C1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANGPTL3Q9Y5C1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANGPTL3Q9Y5C1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANGPTL3Q9Y5C1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ANGPTL3Q9Y5C1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ANGPTL3Q9Y5C1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ANGPTL3Q9Y5C1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ANGPTL3Q9Y5C1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANGPTL3Q9Y5C1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ANGPTL3Q9Y5C1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ANGPTL3Q9Y5C1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ANGPTL3Q9Y5C1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ANGPTL3Q9Y5C1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ANGPTL3Q9Y5C1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ANGPTL3Q9Y5C1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ANGPTL3Q9Y5C1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ANGPTL3Q9Y5C1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ANGPTL3Q9Y5C1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANGPTL3Q9Y5C1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANGPTL3Q9Y5C1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ANGPTL3Q9Y5C1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ANGPTL3Q9Y5C1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ANGPTL3Q9Y5C1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ANGPTL3Q9Y5C1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ANGPTL3Q9Y5C1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ANGPTL3Q9Y5C1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ANGPTL3Q9Y5C1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms