Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE2J1Q9Y385 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2J1Q9Y385 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE2J1Q9Y385 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE2J1Q9Y385 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2J1Q9Y385 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE2J1Q9Y385 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE2J1Q9Y385 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE2J1Q9Y385 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBE2J1Q9Y385 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2J1Q9Y385 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBE2J1Q9Y385 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBE2J1Q9Y385 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBE2J1Q9Y385 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE2J1Q9Y385 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE2J1Q9Y385 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBE2J1Q9Y385 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE2J1Q9Y385 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2J1Q9Y385 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2J1Q9Y385 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2J1Q9Y385 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J1Q9Y385 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2J1Q9Y385 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2J1Q9Y385 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms