Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BTRCQ9Y297 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BTRCQ9Y297 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BTRCQ9Y297 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BTRCQ9Y297 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BTRCQ9Y297 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BTRCQ9Y297 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BTRCQ9Y297 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BTRCQ9Y297 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BTRCQ9Y297 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BTRCQ9Y297 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BTRCQ9Y297 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BTRCQ9Y297 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BTRCQ9Y297 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BTRCQ9Y297 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BTRCQ9Y297 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BTRCQ9Y297 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BTRCQ9Y297 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BTRCQ9Y297 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BTRCQ9Y297 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BTRCQ9Y297 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BTRCQ9Y297 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BTRCQ9Y297 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BTRCQ9Y297 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BTRCQ9Y297 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BTRCQ9Y297 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BTRCQ9Y297 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BTRCQ9Y297 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BTRCQ9Y297 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BTRCQ9Y297 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BTRCQ9Y297 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BTRCQ9Y297 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BTRCQ9Y297 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BTRCQ9Y297 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BTRCQ9Y297 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BTRCQ9Y297 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BTRCQ9Y297 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BTRCQ9Y297 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BTRCQ9Y297 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BTRCQ9Y297 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BTRCQ9Y297 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BTRCQ9Y297 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BTRCQ9Y297 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BTRCQ9Y297 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BTRCQ9Y297 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BTRCQ9Y297 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BTRCQ9Y297 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BTRCQ9Y297 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BTRCQ9Y297 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BTRCQ9Y297 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BTRCQ9Y297 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BTRCQ9Y297 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms