Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y278

HS3ST2, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST2Q9Y278 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HS3ST2Q9Y278 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HS3ST2Q9Y278 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HS3ST2Q9Y278 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HS3ST2Q9Y278 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HS3ST2Q9Y278 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HS3ST2Q9Y278 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HS3ST2Q9Y278 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HS3ST2Q9Y278 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HS3ST2Q9Y278 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HS3ST2Q9Y278 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HS3ST2Q9Y278 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HS3ST2Q9Y278 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HS3ST2Q9Y278 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HS3ST2Q9Y278 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HS3ST2Q9Y278 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HS3ST2Q9Y278 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HS3ST2Q9Y278 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HS3ST2Q9Y278 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HS3ST2Q9Y278 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HS3ST2Q9Y278 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HS3ST2Q9Y278 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HS3ST2Q9Y278 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HS3ST2Q9Y278 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HS3ST2Q9Y278 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HS3ST2Q9Y278 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HS3ST2Q9Y278 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HS3ST2Q9Y278 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HS3ST2Q9Y278 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HS3ST2Q9Y278 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
HS3ST2Q9Y278 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HS3ST2Q9Y278 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HS3ST2Q9Y278 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HS3ST2Q9Y278 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HS3ST2Q9Y278 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HS3ST2Q9Y278 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HS3ST2Q9Y278 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HS3ST2Q9Y278 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HS3ST2Q9Y278 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HS3ST2Q9Y278 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HS3ST2Q9Y278 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HS3ST2Q9Y278 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HS3ST2Q9Y278 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HS3ST2Q9Y278 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HS3ST2Q9Y278 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HS3ST2Q9Y278 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HS3ST2Q9Y278 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HS3ST2Q9Y278 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HS3ST2Q9Y278 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HS3ST2Q9Y278 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HS3ST2Q9Y278 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HS3ST2Q9Y278 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HS3ST2Q9Y278 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HS3ST2Q9Y278 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HS3ST2Q9Y278 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HS3ST2Q9Y278 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HS3ST2Q9Y278 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HS3ST2Q9Y278 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HS3ST2Q9Y278 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HS3ST2Q9Y278 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HS3ST2Q9Y278 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HS3ST2Q9Y278 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HS3ST2Q9Y278 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HS3ST2Q9Y278 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HS3ST2Q9Y278 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HS3ST2Q9Y278 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HS3ST2Q9Y278 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HS3ST2Q9Y278 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HS3ST2Q9Y278 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HS3ST2Q9Y278 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HS3ST2Q9Y278 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HS3ST2Q9Y278 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HS3ST2Q9Y278 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HS3ST2Q9Y278 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HS3ST2Q9Y278 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HS3ST2Q9Y278 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HS3ST2Q9Y278 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HS3ST2Q9Y278 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HS3ST2Q9Y278 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HS3ST2Q9Y278 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HS3ST2Q9Y278 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HS3ST2Q9Y278 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HS3ST2Q9Y278 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms