Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE2

RPH3AL, Rab effector Noc2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3ALQ9UNE2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPH3ALQ9UNE2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPH3ALQ9UNE2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPH3ALQ9UNE2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPH3ALQ9UNE2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPH3ALQ9UNE2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPH3ALQ9UNE2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPH3ALQ9UNE2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPH3ALQ9UNE2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPH3ALQ9UNE2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPH3ALQ9UNE2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3ALQ9UNE2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3ALQ9UNE2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPH3ALQ9UNE2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPH3ALQ9UNE2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPH3ALQ9UNE2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPH3ALQ9UNE2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPH3ALQ9UNE2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPH3ALQ9UNE2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPH3ALQ9UNE2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPH3ALQ9UNE2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPH3ALQ9UNE2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPH3ALQ9UNE2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPH3ALQ9UNE2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPH3ALQ9UNE2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPH3ALQ9UNE2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPH3ALQ9UNE2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPH3ALQ9UNE2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPH3ALQ9UNE2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPH3ALQ9UNE2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPH3ALQ9UNE2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPH3ALQ9UNE2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPH3ALQ9UNE2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPH3ALQ9UNE2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPH3ALQ9UNE2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPH3ALQ9UNE2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPH3ALQ9UNE2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPH3ALQ9UNE2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPH3ALQ9UNE2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPH3ALQ9UNE2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPH3ALQ9UNE2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPH3ALQ9UNE2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPH3ALQ9UNE2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPH3ALQ9UNE2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPH3ALQ9UNE2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPH3ALQ9UNE2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPH3ALQ9UNE2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPH3ALQ9UNE2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPH3ALQ9UNE2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms