Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MGAT4AQ9UM21 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MGAT4AQ9UM21 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MGAT4AQ9UM21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGAT4AQ9UM21 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGAT4AQ9UM21 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGAT4AQ9UM21 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGAT4AQ9UM21 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGAT4AQ9UM21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MGAT4AQ9UM21 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT4AQ9UM21 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT4AQ9UM21 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MGAT4AQ9UM21 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGAT4AQ9UM21 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MGAT4AQ9UM21 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGAT4AQ9UM21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MGAT4AQ9UM21 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MGAT4AQ9UM21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MGAT4AQ9UM21 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms