Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PALD1Q9ULE6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PALD1Q9ULE6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PALD1Q9ULE6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PALD1Q9ULE6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PALD1Q9ULE6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PALD1Q9ULE6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PALD1Q9ULE6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PALD1Q9ULE6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PALD1Q9ULE6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PALD1Q9ULE6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PALD1Q9ULE6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PALD1Q9ULE6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PALD1Q9ULE6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PALD1Q9ULE6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PALD1Q9ULE6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PALD1Q9ULE6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PALD1Q9ULE6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PALD1Q9ULE6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PALD1Q9ULE6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PALD1Q9ULE6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PALD1Q9ULE6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PALD1Q9ULE6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PALD1Q9ULE6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PALD1Q9ULE6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PALD1Q9ULE6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PALD1Q9ULE6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PALD1Q9ULE6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PALD1Q9ULE6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PALD1Q9ULE6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PALD1Q9ULE6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PALD1Q9ULE6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PALD1Q9ULE6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PALD1Q9ULE6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PALD1Q9ULE6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PALD1Q9ULE6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PALD1Q9ULE6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PALD1Q9ULE6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PALD1Q9ULE6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PALD1Q9ULE6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PALD1Q9ULE6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PALD1Q9ULE6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PALD1Q9ULE6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PALD1Q9ULE6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PALD1Q9ULE6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PALD1Q9ULE6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PALD1Q9ULE6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PALD1Q9ULE6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PALD1Q9ULE6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PALD1Q9ULE6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PALD1Q9ULE6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PALD1Q9ULE6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PALD1Q9ULE6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PALD1Q9ULE6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PALD1Q9ULE6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PALD1Q9ULE6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PALD1Q9ULE6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PALD1Q9ULE6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PALD1Q9ULE6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PALD1Q9ULE6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PALD1Q9ULE6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PALD1Q9ULE6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PALD1Q9ULE6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PALD1Q9ULE6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PALD1Q9ULE6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PALD1Q9ULE6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PALD1Q9ULE6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PALD1Q9ULE6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PALD1Q9ULE6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PALD1Q9ULE6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PALD1Q9ULE6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PALD1Q9ULE6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PALD1Q9ULE6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PALD1Q9ULE6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PALD1Q9ULE6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PALD1Q9ULE6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PALD1Q9ULE6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PALD1Q9ULE6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PALD1Q9ULE6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PALD1Q9ULE6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PALD1Q9ULE6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PALD1Q9ULE6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PALD1Q9ULE6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PALD1Q9ULE6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PALD1Q9ULE6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PALD1Q9ULE6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PALD1Q9ULE6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PALD1Q9ULE6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PALD1Q9ULE6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PALD1Q9ULE6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PALD1Q9ULE6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PALD1Q9ULE6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms