Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PRDM4Q9UKN5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PRDM4Q9UKN5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM4Q9UKN5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PRDM4Q9UKN5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM4Q9UKN5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM4Q9UKN5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PRDM4Q9UKN5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PRDM4Q9UKN5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM4Q9UKN5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PRDM4Q9UKN5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM4Q9UKN5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PRDM4Q9UKN5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PRDM4Q9UKN5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM4Q9UKN5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM4Q9UKN5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PRDM4Q9UKN5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PRDM4Q9UKN5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM4Q9UKN5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM4Q9UKN5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PRDM4Q9UKN5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PRDM4Q9UKN5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM4Q9UKN5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRDM4Q9UKN5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM4Q9UKN5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRDM4Q9UKN5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRDM4Q9UKN5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM4Q9UKN5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRDM4Q9UKN5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PRDM4Q9UKN5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PRDM4Q9UKN5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PRDM4Q9UKN5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRDM4Q9UKN5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRDM4Q9UKN5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRDM4Q9UKN5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRDM4Q9UKN5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM4Q9UKN5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRDM4Q9UKN5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRDM4Q9UKN5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRDM4Q9UKN5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRDM4Q9UKN5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM4Q9UKN5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRDM4Q9UKN5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRDM4Q9UKN5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM4Q9UKN5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM4Q9UKN5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PRDM4Q9UKN5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM4Q9UKN5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM4Q9UKN5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM4Q9UKN5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM4Q9UKN5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM4Q9UKN5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM4Q9UKN5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM4Q9UKN5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM4Q9UKN5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM4Q9UKN5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM4Q9UKN5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRDM4Q9UKN5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRDM4Q9UKN5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRDM4Q9UKN5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PRDM4Q9UKN5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRDM4Q9UKN5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM4Q9UKN5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRDM4Q9UKN5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRDM4Q9UKN5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRDM4Q9UKN5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms