Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FBXO3Q9UK99 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FBXO3Q9UK99 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
FBXO3Q9UK99 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FBXO3Q9UK99 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FBXO3Q9UK99 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FBXO3Q9UK99 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FBXO3Q9UK99 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FBXO3Q9UK99 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FBXO3Q9UK99 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FBXO3Q9UK99 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FBXO3Q9UK99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FBXO3Q9UK99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
FBXO3Q9UK99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FBXO3Q9UK99 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
FBXO3Q9UK99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FBXO3Q9UK99 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FBXO3Q9UK99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FBXO3Q9UK99 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FBXO3Q9UK99 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FBXO3Q9UK99 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FBXO3Q9UK99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FBXO3Q9UK99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FBXO3Q9UK99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FBXO3Q9UK99 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FBXO3Q9UK99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FBXO3Q9UK99 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FBXO3Q9UK99 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
FBXO3Q9UK99 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FBXO3Q9UK99 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
FBXO3Q9UK99 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FBXO3Q9UK99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FBXO3Q9UK99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FBXO3Q9UK99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FBXO3Q9UK99 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
FBXO3Q9UK99 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FBXO3Q9UK99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FBXO3Q9UK99 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FBXO3Q9UK99 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FBXO3Q9UK99 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FBXO3Q9UK99 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FBXO3Q9UK99 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
FBXO3Q9UK99 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FBXO3Q9UK99 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FBXO3Q9UK99 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
FBXO3Q9UK99 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FBXO3Q9UK99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
FBXO3Q9UK99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
FBXO3Q9UK99 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FBXO3Q9UK99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
FBXO3Q9UK99 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
FBXO3Q9UK99 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FBXO3Q9UK99 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
FBXO3Q9UK99 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
FBXO3Q9UK99 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
FBXO3Q9UK99 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FBXO3Q9UK99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
FBXO3Q9UK99 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FBXO3Q9UK99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FBXO3Q9UK99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FBXO3Q9UK99 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FBXO3Q9UK99 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FBXO3Q9UK99 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FBXO3Q9UK99 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FBXO3Q9UK99 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FBXO3Q9UK99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FBXO3Q9UK99 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FBXO3Q9UK99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FBXO3Q9UK99 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FBXO3Q9UK99 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
FBXO3Q9UK99 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FBXO3Q9UK99 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FBXO3Q9UK99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FBXO3Q9UK99 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
FBXO3Q9UK99 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FBXO3Q9UK99 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
FBXO3Q9UK99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
FBXO3Q9UK99 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
FBXO3Q9UK99 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
FBXO3Q9UK99 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FBXO3Q9UK99 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FBXO3Q9UK99 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
FBXO3Q9UK99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FBXO3Q9UK99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FBXO3Q9UK99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FBXO3Q9UK99 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FBXO3Q9UK99 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FBXO3Q9UK99 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FBXO3Q9UK99 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FBXO3Q9UK99 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FBXO3Q9UK99 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms