Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CTNNA3Q9UI47 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CTNNA3Q9UI47 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CTNNA3Q9UI47 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CTNNA3Q9UI47 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CTNNA3Q9UI47 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CTNNA3Q9UI47 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CTNNA3Q9UI47 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CTNNA3Q9UI47 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CTNNA3Q9UI47 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CTNNA3Q9UI47 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTNNA3Q9UI47 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTNNA3Q9UI47 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CTNNA3Q9UI47 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CTNNA3Q9UI47 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CTNNA3Q9UI47 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CTNNA3Q9UI47 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTNNA3Q9UI47 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CTNNA3Q9UI47 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CTNNA3Q9UI47 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTNNA3Q9UI47 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CTNNA3Q9UI47 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CTNNA3Q9UI47 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTNNA3Q9UI47 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTNNA3Q9UI47 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CTNNA3Q9UI47 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CTNNA3Q9UI47 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CTNNA3Q9UI47 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CTNNA3Q9UI47 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CTNNA3Q9UI47 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CTNNA3Q9UI47 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CTNNA3Q9UI47 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CTNNA3Q9UI47 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CTNNA3Q9UI47 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CTNNA3Q9UI47 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CTNNA3Q9UI47 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CTNNA3Q9UI47 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CTNNA3Q9UI47 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CTNNA3Q9UI47 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CTNNA3Q9UI47 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CTNNA3Q9UI47 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CTNNA3Q9UI47 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CTNNA3Q9UI47 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CTNNA3Q9UI47 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CTNNA3Q9UI47 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CTNNA3Q9UI47 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CTNNA3Q9UI47 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CTNNA3Q9UI47 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CTNNA3Q9UI47 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CTNNA3Q9UI47 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CTNNA3Q9UI47 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CTNNA3Q9UI47 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CTNNA3Q9UI47 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CTNNA3Q9UI47 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CTNNA3Q9UI47 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CTNNA3Q9UI47 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CTNNA3Q9UI47 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CTNNA3Q9UI47 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CTNNA3Q9UI47 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CTNNA3Q9UI47 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CTNNA3Q9UI47 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CTNNA3Q9UI47 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CTNNA3Q9UI47 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CTNNA3Q9UI47 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CTNNA3Q9UI47 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CTNNA3Q9UI47 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CTNNA3Q9UI47 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CTNNA3Q9UI47 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CTNNA3Q9UI47 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CTNNA3Q9UI47 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTNNA3Q9UI47 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTNNA3Q9UI47 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CTNNA3Q9UI47 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms