Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBQLN2Q9UHD9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBQLN2Q9UHD9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBQLN2Q9UHD9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBQLN2Q9UHD9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBQLN2Q9UHD9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBQLN2Q9UHD9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBQLN2Q9UHD9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBQLN2Q9UHD9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBQLN2Q9UHD9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBQLN2Q9UHD9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBQLN2Q9UHD9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBQLN2Q9UHD9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBQLN2Q9UHD9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBQLN2Q9UHD9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBQLN2Q9UHD9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBQLN2Q9UHD9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBQLN2Q9UHD9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBQLN2Q9UHD9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBQLN2Q9UHD9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBQLN2Q9UHD9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBQLN2Q9UHD9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN2Q9UHD9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBQLN2Q9UHD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBQLN2Q9UHD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBQLN2Q9UHD9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBQLN2Q9UHD9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBQLN2Q9UHD9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBQLN2Q9UHD9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBQLN2Q9UHD9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBQLN2Q9UHD9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBQLN2Q9UHD9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBQLN2Q9UHD9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBQLN2Q9UHD9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBQLN2Q9UHD9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBQLN2Q9UHD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBQLN2Q9UHD9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBQLN2Q9UHD9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBQLN2Q9UHD9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBQLN2Q9UHD9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBQLN2Q9UHD9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBQLN2Q9UHD9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBQLN2Q9UHD9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBQLN2Q9UHD9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBQLN2Q9UHD9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBQLN2Q9UHD9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms