Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMTOR3Q9UHA4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LAMTOR3Q9UHA4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMTOR3Q9UHA4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMTOR3Q9UHA4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMTOR3Q9UHA4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMTOR3Q9UHA4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMTOR3Q9UHA4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LAMTOR3Q9UHA4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LAMTOR3Q9UHA4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LAMTOR3Q9UHA4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LAMTOR3Q9UHA4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LAMTOR3Q9UHA4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LAMTOR3Q9UHA4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMTOR3Q9UHA4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LAMTOR3Q9UHA4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LAMTOR3Q9UHA4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMTOR3Q9UHA4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMTOR3Q9UHA4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMTOR3Q9UHA4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMTOR3Q9UHA4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMTOR3Q9UHA4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMTOR3Q9UHA4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMTOR3Q9UHA4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms