Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SS18L2Q9UHA2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SS18L2Q9UHA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SS18L2Q9UHA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SS18L2Q9UHA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SS18L2Q9UHA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SS18L2Q9UHA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SS18L2Q9UHA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SS18L2Q9UHA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SS18L2Q9UHA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SS18L2Q9UHA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SS18L2Q9UHA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SS18L2Q9UHA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SS18L2Q9UHA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SS18L2Q9UHA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SS18L2Q9UHA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SS18L2Q9UHA2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18L2Q9UHA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SS18L2Q9UHA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SS18L2Q9UHA2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SS18L2Q9UHA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18L2Q9UHA2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SS18L2Q9UHA2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SS18L2Q9UHA2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SS18L2Q9UHA2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SS18L2Q9UHA2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18L2Q9UHA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SS18L2Q9UHA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SS18L2Q9UHA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SS18L2Q9UHA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SS18L2Q9UHA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SS18L2Q9UHA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SS18L2Q9UHA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SS18L2Q9UHA2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18L2Q9UHA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms