Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC59Q9P031 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC59Q9P031 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC59Q9P031 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC59Q9P031 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC59Q9P031 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC59Q9P031 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC59Q9P031 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC59Q9P031 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC59Q9P031 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC59Q9P031 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC59Q9P031 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC59Q9P031 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC59Q9P031 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC59Q9P031 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC59Q9P031 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC59Q9P031 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC59Q9P031 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC59Q9P031 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC59Q9P031 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC59Q9P031 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC59Q9P031 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC59Q9P031 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC59Q9P031 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC59Q9P031 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC59Q9P031 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC59Q9P031 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC59Q9P031 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC59Q9P031 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC59Q9P031 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC59Q9P031 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC59Q9P031 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC59Q9P031 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC59Q9P031 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC59Q9P031 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC59Q9P031 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC59Q9P031 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC59Q9P031 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC59Q9P031 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC59Q9P031 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC59Q9P031 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC59Q9P031 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC59Q9P031 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC59Q9P031 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC59Q9P031 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC59Q9P031 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC59Q9P031 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC59Q9P031 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC59Q9P031 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC59Q9P031 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC59Q9P031 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC59Q9P031 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC59Q9P031 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC59Q9P031 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC59Q9P031 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC59Q9P031 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC59Q9P031 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC59Q9P031 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC59Q9P031 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC59Q9P031 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC59Q9P031 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC59Q9P031 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms