Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
FANCIQ9NVI1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FANCIQ9NVI1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FANCIQ9NVI1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FANCIQ9NVI1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FANCIQ9NVI1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
FANCIQ9NVI1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FANCIQ9NVI1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FANCIQ9NVI1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
FANCIQ9NVI1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FANCIQ9NVI1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FANCIQ9NVI1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
FANCIQ9NVI1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
FANCIQ9NVI1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FANCIQ9NVI1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
FANCIQ9NVI1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FANCIQ9NVI1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FANCIQ9NVI1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FANCIQ9NVI1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCIQ9NVI1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FANCIQ9NVI1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.62
FANCIQ9NVI1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FANCIQ9NVI1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
FANCIQ9NVI1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FANCIQ9NVI1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FANCIQ9NVI1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FANCIQ9NVI1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
FANCIQ9NVI1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FANCIQ9NVI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
FANCIQ9NVI1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
FANCIQ9NVI1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
FANCIQ9NVI1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FANCIQ9NVI1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FANCIQ9NVI1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
FANCIQ9NVI1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
FANCIQ9NVI1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FANCIQ9NVI1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FANCIQ9NVI1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
FANCIQ9NVI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
FANCIQ9NVI1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
FANCIQ9NVI1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
FANCIQ9NVI1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
FANCIQ9NVI1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
FANCIQ9NVI1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FANCIQ9NVI1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FANCIQ9NVI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
FANCIQ9NVI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
FANCIQ9NVI1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
FANCIQ9NVI1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
FANCIQ9NVI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
FANCIQ9NVI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
FANCIQ9NVI1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
FANCIQ9NVI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCIQ9NVI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCIQ9NVI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCIQ9NVI1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
FANCIQ9NVI1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
FANCIQ9NVI1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
FANCIQ9NVI1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FANCIQ9NVI1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FANCIQ9NVI1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
FANCIQ9NVI1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FANCIQ9NVI1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
FANCIQ9NVI1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
FANCIQ9NVI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
FANCIQ9NVI1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCIQ9NVI1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FANCIQ9NVI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms