Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVA1

UQCC1, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC1Q9NVA1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UQCC1Q9NVA1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UQCC1Q9NVA1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCC1Q9NVA1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UQCC1Q9NVA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCC1Q9NVA1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UQCC1Q9NVA1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UQCC1Q9NVA1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UQCC1Q9NVA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UQCC1Q9NVA1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UQCC1Q9NVA1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UQCC1Q9NVA1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UQCC1Q9NVA1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCC1Q9NVA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UQCC1Q9NVA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UQCC1Q9NVA1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCC1Q9NVA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCC1Q9NVA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCC1Q9NVA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UQCC1Q9NVA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCC1Q9NVA1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCC1Q9NVA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCC1Q9NVA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCC1Q9NVA1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCC1Q9NVA1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCC1Q9NVA1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UQCC1Q9NVA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UQCC1Q9NVA1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCC1Q9NVA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCC1Q9NVA1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCC1Q9NVA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCC1Q9NVA1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UQCC1Q9NVA1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC1Q9NVA1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCC1Q9NVA1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UQCC1Q9NVA1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCC1Q9NVA1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UQCC1Q9NVA1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UQCC1Q9NVA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UQCC1Q9NVA1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UQCC1Q9NVA1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UQCC1Q9NVA1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UQCC1Q9NVA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UQCC1Q9NVA1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UQCC1Q9NVA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UQCC1Q9NVA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UQCC1Q9NVA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UQCC1Q9NVA1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UQCC1Q9NVA1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UQCC1Q9NVA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UQCC1Q9NVA1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UQCC1Q9NVA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UQCC1Q9NVA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UQCC1Q9NVA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UQCC1Q9NVA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UQCC1Q9NVA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UQCC1Q9NVA1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UQCC1Q9NVA1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UQCC1Q9NVA1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UQCC1Q9NVA1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCC1Q9NVA1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UQCC1Q9NVA1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UQCC1Q9NVA1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UQCC1Q9NVA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UQCC1Q9NVA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms