Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FBXO8Q9NRD0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FBXO8Q9NRD0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO8Q9NRD0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FBXO8Q9NRD0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FBXO8Q9NRD0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FBXO8Q9NRD0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FBXO8Q9NRD0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO8Q9NRD0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO8Q9NRD0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FBXO8Q9NRD0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FBXO8Q9NRD0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO8Q9NRD0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FBXO8Q9NRD0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FBXO8Q9NRD0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FBXO8Q9NRD0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FBXO8Q9NRD0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FBXO8Q9NRD0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FBXO8Q9NRD0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FBXO8Q9NRD0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FBXO8Q9NRD0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FBXO8Q9NRD0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FBXO8Q9NRD0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FBXO8Q9NRD0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FBXO8Q9NRD0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO8Q9NRD0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FBXO8Q9NRD0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO8Q9NRD0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FBXO8Q9NRD0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FBXO8Q9NRD0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FBXO8Q9NRD0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FBXO8Q9NRD0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO8Q9NRD0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FBXO8Q9NRD0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FBXO8Q9NRD0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO8Q9NRD0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO8Q9NRD0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FBXO8Q9NRD0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO8Q9NRD0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FBXO8Q9NRD0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FBXO8Q9NRD0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FBXO8Q9NRD0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FBXO8Q9NRD0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FBXO8Q9NRD0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FBXO8Q9NRD0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO8Q9NRD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO8Q9NRD0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO8Q9NRD0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO8Q9NRD0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO8Q9NRD0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO8Q9NRD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO8Q9NRD0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO8Q9NRD0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO8Q9NRD0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO8Q9NRD0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXO8Q9NRD0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO8Q9NRD0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO8Q9NRD0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO8Q9NRD0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO8Q9NRD0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO8Q9NRD0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO8Q9NRD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO8Q9NRD0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO8Q9NRD0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO8Q9NRD0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO8Q9NRD0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO8Q9NRD0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO8Q9NRD0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO8Q9NRD0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXO8Q9NRD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO8Q9NRD0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO8Q9NRD0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO8Q9NRD0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO8Q9NRD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO8Q9NRD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms